Sinds de start van de “War on Terror” zijn al meer dan 100 door de Amerikanen in voorhechtenis gehouden verdachten onder vreemde omstandigheden gestorven. De Afghaanse taxichauffeur Dilawar, die vijf dagen na zijn arrestatie op mysterieuze wijze sterft in zijn cel in Bagram, is één van hen. De autopsie stelt vast dat de taxichauffeur overleed ten gevolge van ernstige letsels. Of met andere woorden: Dilawar werd doodgeslagen. Taxi to the Dark Side reconstrueert de laatste uren van de Afghaanse taxichauffeur die op de verkeerde tijd op de verkeerde plek was. Aan de hand van het verhaal van Dilawar stelt regisseur Alex Gibney de dubieuze ondervragingstechnieken van het Witte Huis aan de kaak en laat zien hoe het Amerikaanse Congres de voeten veegt aan het Verdrag van Genève.